Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnft1Q9DCN7 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms