Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn22Q9D7U6 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms