Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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PtprtQ99M80 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Slc5a6-201ENSMUST00000080431 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
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PtprtQ99M80 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
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PtprtQ99M80 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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PtprtQ99M80 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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PtprtQ99M80 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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PtprtQ99M80 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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PtprtQ99M80 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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PtprtQ99M80 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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PtprtQ99M80 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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PtprtQ99M80 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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PtprtQ99M80 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
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