Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ccser1Q8C0C4 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccser1Q8C0C4 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms