Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 AC131745.3-201ENSMUST00000223582 554 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Ube2e2-201ENSMUST00000076133 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 1700034H15Rik-205ENSMUST00000154116 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Pisrt1-201ENSMUST00000195532 515 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms