Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms