Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ccdc18Q640L5 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ccdc18Q640L5 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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