Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Mrps18c-202ENSMUST00000112898 460 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms