Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q3U6N9 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Q3U6N9 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Q3U6N9 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Q3U6N9 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Q3U6N9 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms