Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms