Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Taf1bP97358 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Taf1bP97358 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Taf1bP97358 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Taf1bP97358 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Taf1bP97358 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Taf1bP97358 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Taf1bP97358 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Taf1bP97358 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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