Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Irx1P81068 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Irx1P81068 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Irx1P81068 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Irx1P81068 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Irx1P81068 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Irx1P81068 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Irx1P81068 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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Irx1P81068 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Irx1P81068 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Irx1P81068 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Irx1P81068 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Irx1P81068 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Irx1P81068 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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Irx1P81068 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Irx1P81068 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Irx1P81068 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Irx1P81068 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Irx1P81068 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Irx1P81068 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Irx1P81068 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Irx1P81068 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Irx1P81068 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Irx1P81068 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Irx1P81068 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Irx1P81068 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Irx1P81068 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Irx1P81068 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Irx1P81068 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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