Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Sh3bp1P55194 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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