Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
SrprbP47758 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
SrprbP47758 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
SrprbP47758 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
SrprbP47758 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
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SrprbP47758 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
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SrprbP47758 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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SrprbP47758 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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SrprbP47758 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
SrprbP47758 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
SrprbP47758 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
SrprbP47758 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
SrprbP47758 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms