Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Olfr981-202ENSMUST00000215956 8197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
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PtprmP28828 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
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PtprmP28828 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
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