Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
RxraP28700 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
RxraP28700 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
RxraP28700 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
RxraP28700 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms