Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm10651-201ENSMUST00000118212 609 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm20388-201ENSMUST00000127664 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd9P28357 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms