Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TtrP07309 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
TtrP07309 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
TtrP07309 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
TtrP07309 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
TtrP07309 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
TtrP07309 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
TtrP07309 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TtrP07309 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms