Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms