Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Cldn34c3J3QJW5 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 272.9 ms