Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Slc5a6-201ENSMUST00000080431 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usp9yF8VPU6 Akap2-206ENSMUST00000107598 6830 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms