Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms