Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Grik3B1AS29 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms