Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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