Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Fmr1-206ENSMUST00000114657 4076 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 St3gal1-201ENSMUST00000092640 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Olfr1276-203ENSMUST00000218065 5052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
PtprtQ99M80 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms