Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Top1mtQ8R4U6 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Top1mtQ8R4U6 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Top1mtQ8R4U6 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Top1mtQ8R4U6 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Top1mtQ8R4U6 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Top1mtQ8R4U6 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Top1mtQ8R4U6 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Top1mtQ8R4U6 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Top1mtQ8R4U6 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Top1mtQ8R4U6 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Top1mtQ8R4U6 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Top1mtQ8R4U6 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Top1mtQ8R4U6 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Top1mtQ8R4U6 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Top1mtQ8R4U6 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Top1mtQ8R4U6 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms