Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Ttc29Q80VM3 AC167013.5-201ENSMUST00000227597 2947 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Ttc29Q80VM3 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms