Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 9530053A07Rik-204ENSMUST00000150948 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Hivep2-205ENSMUST00000191138 9846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 1110002E22Rik-201ENSMUST00000163080 9741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120 ms