Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms