Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Chsy1Q6ZQ11 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms