Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CtifQ6PEE2 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CtifQ6PEE2 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms