Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Fmr1-206ENSMUST00000114657 4076 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Thbs1-201ENSMUST00000039559 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NipblQ6KCD5 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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