Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc18Q640L5 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Akap2-206ENSMUST00000107598 6830 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc18Q640L5 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms