Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm26070-201ENSMUST00000157500 137 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm21013-201ENSMUST00000184952 1201 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm2237-201ENSMUST00000112595 471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms