Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Syne3Q4FZC9 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms