Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms