Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irx1P81068 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms