Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28968-201ENSMUST00000190413 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
SbdsP70122 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SbdsP70122 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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