Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Vmn1r193-203ENSMUST00000227562 6840 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Mroh2a-201ENSMUST00000061013 7526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
PtprmP28828 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Oasl2-201ENSMUST00000031542 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprmP28828 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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