Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
RxraP28700 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
RxraP28700 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
RxraP28700 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms