Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Spag11a-201ENSMUST00000058955 436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Slc36a3-202ENSMUST00000069816 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PdgfaP20033 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm38110-201ENSMUST00000194594 1551 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm13500-201ENSMUST00000119348 824 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 A630023P12Rik-201ENSMUST00000129007 1221 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm18779-201ENSMUST00000173444 577 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Spa17-201ENSMUST00000002013 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 AC167019.4-201ENSMUST00000226494 1070 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Ly6f-201ENSMUST00000023247 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Olfr1286-201ENSMUST00000099617 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Cnot2-209ENSMUST00000167706 1621 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 4930578I07Rik-201ENSMUST00000193416 1372 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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