Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Ctns-202ENSMUST00000108476 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm16630-201ENSMUST00000180741 3257 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms