Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Vpreb2P13373 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms