Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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Ccl20O89093 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Ccl20O89093 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Ccl20O89093 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Ccl20O89093 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Ccl20O89093 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Ccl20O89093 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Ccl20O89093 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Ccl20O89093 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Ccl20O89093 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Ccl20O89093 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Ccl20O89093 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccl20O89093 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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