Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Sp100O35892 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Sp100O35892 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Sp100O35892 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Sp100O35892 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Sp100O35892 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Sp100O35892 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sp100O35892 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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