Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Vmn1r181-202ENSMUST00000226843 4496 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Med12-202ENSMUST00000087956 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NischQ80TM9 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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