Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 AC156025.3-201ENSMUST00000225919 3095 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trak1Q6PD31 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms