Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
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Usp49Q6P9L4 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Usp49Q6P9L4 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Usp49Q6P9L4 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Usp49Q6P9L4 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Usp49Q6P9L4 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Usp49Q6P9L4 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Usp49Q6P9L4 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms