Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Med12-202ENSMUST00000087956 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Sptan1-202ENSMUST00000095083 7883 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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