Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Nalcn-201ENSMUST00000000201 7122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Siah1bQ06985 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms